FG Kowarik

Neurologische B-Zell Immunologie

Die Forschungsgruppe „Neurologische B-Zell Immunologie“ beschäftigt sich primär mit der Rolle von B-Zellen bei neuro-inflammatorischen Erkrankungen des Zentralnervensystems (ZNS) wie der Multiplen Sklerose und Neuromyelitis-optica-Spektrum-Erkrankung (NMOSD). Während bei der NMOSD die Produktion von pathologisch relevanten Antikörpern gegen Aquaporin-4 Wasserkanäle eindeutig nachgewiesen werden konnte, ist die Rolle von B Zellen bei der Multiplen Sklerose aktuell noch nicht hinreichend verstanden. Durch den erfolgreichen Einsatz von B-Zell depletierenden Therapien in der Multiplen Sklerose konnte ein relevanter Einfluss von B-Zellen in der Pathogenese jedoch klar belegt werden. Ziel der Arbeitsgruppe ist es, die Rolle von B Zellen bei der Multiplen Sklerose als auch bei anderen Autoimmunerkrankungen im Detail zu verstehen. In einem interdisziplinären Ansatz wird auch untersucht, ob und in welcher Funktion B Zellen bei primär nicht-inflammatorischen Erkrankungen (z.B. Schlaganfällen, zerebrale Tumore u.a.) pathophysiologisch relevant sind.

Methodik
Mitarbeitende
Publikationen
Partner und Kooperationen


Immunglobulin Repertoire Analyse auf Transkriptom Ebene

 

Mittels „next-generation“ Massensequenzierung können umfangreich Immunglobulin (Ig) Sequenzen auf Transkriptom Ebene erfasst werden. Durch bioinformatische Ansätze werden diese Immunglobulin Repertoire weiter bearbeitet und in Bezug auf z.B. Ig Subklassen, Diversität und Klonalität untersucht. Des Weiteren können Reifungsbäume erstellt werden, anhand derer auch Migrationsprozesse von B Zellen nachzuverfolgen sind.

Beispiel für einen B-Zell Reifungsbaum, bei dem eine Liquor B Zelle (blau) in direktem Bezug zu einem peripheren B Zell Cluster (rote Punkte) steht und mutmaßlich direkt von einer B Zelle im peripheren Blut abstammt. Migrationsprozesse von B Zellen zwischen z.B. Blut- und Liquor-Kompartiment können hierdurch im Detail untersucht werden.

 

Immunglobulin Repertoire Analyse auf Proteom Ebene 

 

Die Immunglobulin (Ig) Fraktion wird in dieser Analyse von anderen (Serum-)Proteinen separiert, in kleine Peptid-Fragmente zerlegt und anschließend mittels Massen-Spektroskopie analysiert. Die daraus resultierenden Ig Peptid Fragmente können dann mit den Ig Transkriptom Repertoiren in spezifischen Bereichen überlappt werden, um die Dynamik zwischen B Zell Reifung und anschließender Antikörperproduktion im Detail zu untersuchen.  

Überlappung zwischen Ig Transkriptom und Ig Proteom: Immunglobulin Peptide (gelb unterlegt) werden mit Ig Transkriptom Repertoiren abgeglichen und hinsichtlich Spezifität (Mutationen zur Keimbahn-Sequenz, grün markiert) untersucht. Hierdurch kann differenziert werden, in welchem Umfang zirkulierende B Zellen zur tatsächlichen Antikörperproduktion beitragen.

 

Einzelzell Analyse von B Zellen

 

Durch die Einzelzell Analyse von B Zellen können die leichte als auch schwere Immunglogulinen Kette von einzelnen B Zellen erfasst und anschließend in einem aufwändigen Verfahren rekombinante Antikörper hergestellt werden. Diese Antikörper können zum einen hinsichtlich ihres Target-Antigens untersucht werden und zudem funktionelle Aspekte erfasst werden.


 
Name
Arbeitsgruppe
Telefon
E-Mail
 Lena Beller
Lena BellerMedical Student
B-Cell-Immunology

+49 (0)7071-
29-88886

 
 Evelyn Dubois
Evelyn DuboisTechnical Assistant
B-Cell-Immunology

07071
29-85171

 
PD Dr. Markus Kowarik
PD Dr. Markus KowarikResearch Group Leader
B-Cell-Immunology

07071
29-87529

 
 Annette Maier
Annette MaierTechnical Assistant
B-Cell-Immunology

+49 (0)7071-
29-88886

 
 Natalie Rumpel
Natalie RumpelStudy Nurse
B-Cell-Immunology

07071
86703

 
Dr. Christoph Ruschil
Dr. Christoph RuschilPhysician
B-Cell-Immunology

07071
29 61893

 
 Sonja Schembecker
Sonja SchembeckerPhD Student
B-Cell-Immunology

+49 (0)7071-
29-88885

 
 Nicole Vasilenko
Nicole VasilenkoPhD Student
B-Cell-Immunology

+49(0)7071/
2988886

 


Ruschil C
, Kemmerer CL, Beller L, Gabernet G, Kowarik MC. Next Generation Sequencing of Cerebrospinal Fluid B Cell Repertoires in Multiple Sclerosis and Other Neuro-Inflammatory Diseases-A Comprehensive Review. Diagnostics (Basel). 2021 Oct 11;11(10):1871.

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Die Projekte finden in enger Kooperation mit Herrn PD Dr. M. Krumbholz und Mitarbeitern statt.

Prof. U. Naumann: Molekulare Neuro-Onkologie Hertie Institut für klinische Hirnforschung

Dr. S. Nahnsen: Zentrum für Quantitative Biologie (QBiC)

Dr. S Autenrieth: Flow Cytometry Core Facility, Universitätsklinikum Tübingen

Dr. N. Casadei: Sequencing Core facility, Universitätsklinikum Tübingen

 

Internationale Kooperation:

Jeffrey Bennett und Greg Owens, Department of Neurology, University of Colorado, USA 

Forschungsgruppen

Leitung Forschungsgruppe
PD Dr. Markus Kowarikmarkus.kowarik@med.uni-tuebingen.deAnschrift

Hertie-Zentrum für Neurologie

Hertie-Institut für klinische Hirnforschung

Abteilung Neurologie mit Schwerpunkt neurovaskuläre Erkrankungen

Hoppe-Seyler-Straße 3
72076 Tübingen

Tel.: +49 (0)7071 29-68298
Fax: +49 (0)7071 29-25155